Publicerad: 2025-01-30
Doktorandplats i medicinsk vetenskap
Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.Doktorandplats i medicinsk vetenskap
Titel på projektet: Bioinformatik, Evolution och Patogenicitet
Universitetsgemensam information om vad det innebär att vara doktorand vid Göteborgs universitet kan du finna på universitetets doktorandsidor https://www.gu.se/utbildning-till-att-bli-forskare
Arbetsuppgifter
Utbildning i medicinsk vetenskap består i att genomföra ett vetenskapligt projekt och att delta i kurser på forskarnivå om minst 30 högskolepoäng. Utbildningen avslutas med att doktoranden skriver en vetenskaplig sammanläggningsavhandling eller en monografi motsvarande minst 120 högskolepoäng. För mer information om utbildning på forskarnivå vid Sahlgrenska akademin se https://www.gu.se/sahlgrenska-akademin/var-forskarutbildning
Projekt: von Mentzer-labbet vid Göteborgs universitet söker en doktorand för ett forskningsprojekt som kombinerar datadrivna metoder för att förstå bakteriell evolution och patogenicitet. Projektet fokuserar på att använda avancerade datorbaserade verktyg – såsom bioinformatik, maskininlärning och storskalig analys av genomiska data – för att förstå hur patogena Escherichia coli (E. coli) utvecklas och anpassar sig till olika värdar. Projektet har ett data-drivet fokus, med möjlighet att komplettera analyserna med molekylärbiologiska tekniker för att validera nyckelfynd.
Centrala forskningsområden:
• Datorbaserad analys och maskininlärningsmodeller för att studera bakteriella ytproteiner och deras roll i värd-patogeninteraktioner
• Bioinformatisk identifiering och karakterisering av genetiska signaturer som driver utvecklingen av nya patogena E. coli-varianter
• Storskalig genomanalys för att kartlägga spridningen av mobila genetiska element som bär virulens- och resistensgener
Som en del av denna doktorandplats kommer du att ingå i DDLS forskarskola, som erbjuder ett utmärkt utbildningsprogram inom datadriven livsvetenskap. Forskarutbildningen ger dig möjlighet att utveckla avancerade datorkunskaper, delta i tvärvetenskaplig forskning och bygga ett starkt nätverk inom SciLifeLab. Du kommer också att vara en del av CARe – Centrum för antibiotikaresistensforskning i Göteborg. CARe är ett tvärvetenskapligt kompetenscentrum som kopplar samman flera universitet och sjukhus i regionen och erbjuder en unik miljö för samarbetsforskning som adresserar globala hälsofrågor.
Doktorandplatsen är tvärvetenskaplig och kombinerar datavetenskap och bioinformatik med tillämpningar inom biologi och medicin. En stor del av forskningen kommer att genomföras i samarbete med forskare från olika discipliner, inklusive ett nära partnerskap med Chalmers tekniska högskola.
Handledarteamet inkluderar:
Huvudhandledare Dr. Astrid von Mentzer:
Expert inom mikrobiell genomik och bakteriell evolution, som leder projektets datadrivna delar.
Bihandledare Professor Erik Kristiansson (Chalmers Tekniska Högskola):
Specialist inom bioinformatik och maskininlärning, som ger vägledning i beräkningsmetoder och avancerad dataanalys.
Bihandledare Dr. Carl-Fredrik Flach (Göteborgs universitet):
Expert inom miljömikrobiologi, som bidrar med biologiska perspektiv och insikter i forskningen.
Detta tvärvetenskapliga projekt syftar till att öka vår förståelse för bakteriell anpassningsförmåga och evolution, med målet att förbättra diagnostik, behandlingar och förebyggande strategier.
Vi söker en motiverad, självständig och nyfiken kandidat. En bakgrund inom datavetenskap, bioinformatik, matematik, systembiologi, bioteknik eller ett närliggande område är meriterande. Projektet fokuserar på att utforska frågor inom bakteriell genomik med hjälp av avancerade datorbaserade metoder. Erfarenhet av att analysera storskaliga biologiska data, samt kunskaper i programmering och datoranvändning (t.ex. Python och R), är en fördel. Vana vid Linux/UNIX-miljöer och gärna erfarenhet av maskininlärning eller artificiell intelligens är också meriterande. Goda skriftliga och muntliga färdigheter i engelska är viktiga för denna doktorandplats.
Forskarutbildning omfattar fyra års heltidsstudier och leder fram till en doktorsexamen. Inom ramen för din doktorandanställning kan du ha institutionstjänstgöring i en omfattning av max 20 % av heltid fördelat under hela utbildningstiden vilket i så fall genererar motsvarande förlängning av utbildningstiden. Institutionstjänstgöring omfattar vanligtvis undervisning på grundnivå och avancerad nivå, men även forskning och administration kan ingå.
Kontaktuppgifter för doktorandplatsen
Har du frågor om projektet är du välkommen att kontakta huvudhandledaren,
Astrid von Mentzer, Institutionen för biomedicin,
e-post: astrid.von.mentzer@gu.se
Website: Link von Mentzer Lab
Ansökan
För ytterligare information och för att söka platsen se den fullständiga annonsen på https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar
Ansökan ska vara inkommen senast: 2025-02-27
Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.
Universitetet tillämpar individuell lönesättning.
Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.
Titel på projektet: Bioinformatik, Evolution och Patogenicitet
Universitetsgemensam information om vad det innebär att vara doktorand vid Göteborgs universitet kan du finna på universitetets doktorandsidor https://www.gu.se/utbildning-till-att-bli-forskare
Arbetsuppgifter
Utbildning i medicinsk vetenskap består i att genomföra ett vetenskapligt projekt och att delta i kurser på forskarnivå om minst 30 högskolepoäng. Utbildningen avslutas med att doktoranden skriver en vetenskaplig sammanläggningsavhandling eller en monografi motsvarande minst 120 högskolepoäng. För mer information om utbildning på forskarnivå vid Sahlgrenska akademin se https://www.gu.se/sahlgrenska-akademin/var-forskarutbildning
Projekt: von Mentzer-labbet vid Göteborgs universitet söker en doktorand för ett forskningsprojekt som kombinerar datadrivna metoder för att förstå bakteriell evolution och patogenicitet. Projektet fokuserar på att använda avancerade datorbaserade verktyg – såsom bioinformatik, maskininlärning och storskalig analys av genomiska data – för att förstå hur patogena Escherichia coli (E. coli) utvecklas och anpassar sig till olika värdar. Projektet har ett data-drivet fokus, med möjlighet att komplettera analyserna med molekylärbiologiska tekniker för att validera nyckelfynd.
Centrala forskningsområden:
• Datorbaserad analys och maskininlärningsmodeller för att studera bakteriella ytproteiner och deras roll i värd-patogeninteraktioner
• Bioinformatisk identifiering och karakterisering av genetiska signaturer som driver utvecklingen av nya patogena E. coli-varianter
• Storskalig genomanalys för att kartlägga spridningen av mobila genetiska element som bär virulens- och resistensgener
Som en del av denna doktorandplats kommer du att ingå i DDLS forskarskola, som erbjuder ett utmärkt utbildningsprogram inom datadriven livsvetenskap. Forskarutbildningen ger dig möjlighet att utveckla avancerade datorkunskaper, delta i tvärvetenskaplig forskning och bygga ett starkt nätverk inom SciLifeLab. Du kommer också att vara en del av CARe – Centrum för antibiotikaresistensforskning i Göteborg. CARe är ett tvärvetenskapligt kompetenscentrum som kopplar samman flera universitet och sjukhus i regionen och erbjuder en unik miljö för samarbetsforskning som adresserar globala hälsofrågor.
Doktorandplatsen är tvärvetenskaplig och kombinerar datavetenskap och bioinformatik med tillämpningar inom biologi och medicin. En stor del av forskningen kommer att genomföras i samarbete med forskare från olika discipliner, inklusive ett nära partnerskap med Chalmers tekniska högskola.
Handledarteamet inkluderar:
Huvudhandledare Dr. Astrid von Mentzer:
Expert inom mikrobiell genomik och bakteriell evolution, som leder projektets datadrivna delar.
Bihandledare Professor Erik Kristiansson (Chalmers Tekniska Högskola):
Specialist inom bioinformatik och maskininlärning, som ger vägledning i beräkningsmetoder och avancerad dataanalys.
Bihandledare Dr. Carl-Fredrik Flach (Göteborgs universitet):
Expert inom miljömikrobiologi, som bidrar med biologiska perspektiv och insikter i forskningen.
Detta tvärvetenskapliga projekt syftar till att öka vår förståelse för bakteriell anpassningsförmåga och evolution, med målet att förbättra diagnostik, behandlingar och förebyggande strategier.
Vi söker en motiverad, självständig och nyfiken kandidat. En bakgrund inom datavetenskap, bioinformatik, matematik, systembiologi, bioteknik eller ett närliggande område är meriterande. Projektet fokuserar på att utforska frågor inom bakteriell genomik med hjälp av avancerade datorbaserade metoder. Erfarenhet av att analysera storskaliga biologiska data, samt kunskaper i programmering och datoranvändning (t.ex. Python och R), är en fördel. Vana vid Linux/UNIX-miljöer och gärna erfarenhet av maskininlärning eller artificiell intelligens är också meriterande. Goda skriftliga och muntliga färdigheter i engelska är viktiga för denna doktorandplats.
Forskarutbildning omfattar fyra års heltidsstudier och leder fram till en doktorsexamen. Inom ramen för din doktorandanställning kan du ha institutionstjänstgöring i en omfattning av max 20 % av heltid fördelat under hela utbildningstiden vilket i så fall genererar motsvarande förlängning av utbildningstiden. Institutionstjänstgöring omfattar vanligtvis undervisning på grundnivå och avancerad nivå, men även forskning och administration kan ingå.
Kontaktuppgifter för doktorandplatsen
Har du frågor om projektet är du välkommen att kontakta huvudhandledaren,
Astrid von Mentzer, Institutionen för biomedicin,
e-post: astrid.von.mentzer@gu.se
Website: Link von Mentzer Lab
Ansökan
För ytterligare information och för att söka platsen se den fullständiga annonsen på https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar
Ansökan ska vara inkommen senast: 2025-02-27
Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.
Universitetet tillämpar individuell lönesättning.
Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.