Publicerad: 2025-04-15
Postdoktor inom evolution av strukturella varianter hos hotade arter
Naturhistoriska riksmuseet är en statlig myndighet med regeringens uppdrag att främja kunskapen, forskningen och intresset för vår värld. Myndigheten är en framstående forskningsinstitution och Sveriges största museum. Museet har under mer än 200 år samlat in föremål och data och bedrivit forskning om livet på jorden. Samlingarna innehåller fler än 11 miljoner växter, djur, svampar, miljöprover, mineral och fossil. All forskning och kunskap delas i utställningarna, Cosmonova och i aktiviteter på museet och digitalt.
ARBETSUPPGIFTER
Avdelningen för bioinformatik och genetik vid Naturhistoriska riksmuseet söker en motiverad postdoktor för en tvåårig tjänst med fokus på evolutionen av strukturella varianter i genomerna hos hotade arter. Postdoktorn kommer initialt att analysera genomer från skandinaviska brunbjörnar samt ytterligare populationer för att identifiera strukturella varianter med hjälp av långläst sekvensering från Oxford Nanopore och PacBio-teknologier. Forskningsuppgifterna inkluderar:
• Konstruktion av pangenomgrafer för att underlätta inpassning av både lång- och kortläst sekvenseringsdata.
• Identifiering av strukturella varianter och bedömning av deras påverkan på den genetiska belastningen.
• Undersökning av adaptiva strukturella varianter som kan spela en roll i evolutionära processer.
I takt med att projektet fortskrider finns möjlighet att inkludera ytterligare arter, såsom lodjur och varg.
Postdoktorn kommer att handledas av Dr. Tom van der Valk och vara baserad vid Centrum för paleogenomik i Stockholm, ett samarbetsinstitut mellan Naturhistoriska riksmuseet och Stockholms universitet.
KVALIFIKATIONER
För att lyckas i tjänsten behöver du uppfylla medan krav:
• Doktorsexamen i biologi eller ett närliggande ämne.
• Dokumenterad expertis inom ett relevant forskningsområde
• Utmärkt skriftlig och muntlig engelska
• Kunskap om teori inom populations- och bevarandegenomik samt praktisk erfarenhet av genomiska analyser
• Erfarenhet av analys av helgenomsekvenseringsdata (Oxford Nanopore, PacBio och/eller Illumina)
Utöver de grundläggande kvalifikationerna är erfarenhet inom följande områden meriterande
• Erfarenhet av att identifiera strukturella varianter från genomsekvenseringsdata
• Erfarenhet av bioinformatik, inklusive bash-kommandoradsskriptning samt programmering i Python och/eller R
• Erfarenhet av att arbeta med högpresterande datorkluster (HPC).
• Stort intresse för och erfarenhet av forskning inom bevarandegenomik
Du har stark analytisk förmåga och problemlösningsförmåga liksom förmåga att arbeta både självständigt och i samarbete med andra. Du har även en proaktiv och strukturerad inställning till forskning.
ÖVRIGT
Ansökan ska innehålla följande dokument:
• Ett personligt brev (max 1 sida) som inkluderar:
- En beskrivning av ditt forskningsintresse.
- En kort sammanfattning av din vetenskapliga bakgrund och forskningsintressen.
- En personlig reflektion kring hur dina kvalifikationer passar för denna tjänst.
• En meritförteckning (CV) som sammanfattar din utbildning, forskningserfarenhet och relevanta tjänster.
• En publikationslista samt akademiska arbeten som du vill att bedömningskommittén ska beakta.
• En kopia av din doktorsexamen.
• Kontaktuppgifter till två referenser, inklusive deras relation till dig, e-postadress och telefonnummer.
Vårt mål är att genom forskning och publik verksamhet visa vägen till ökad kunskap och handlingskraft, för att vi tillsammans ska kunna bidra till en hållbar och ljus framtid. Vår långsiktiga strävan är att Naturhistoriska riksmuseets anställda ska spegla den mångfald som finns i Sverige. Vi välkomnar alla sökanden oavsett kön, bakgrund, ursprung och funktionsvariation.
Inför rekryteringsarbetet har vi tagit ställning till rekryteringskanaler och marknadsföring. Vi undanbeder oss därför kontakt med mediesäljare, rekryteringssajter och liknande.
ARBETSUPPGIFTER
Avdelningen för bioinformatik och genetik vid Naturhistoriska riksmuseet söker en motiverad postdoktor för en tvåårig tjänst med fokus på evolutionen av strukturella varianter i genomerna hos hotade arter. Postdoktorn kommer initialt att analysera genomer från skandinaviska brunbjörnar samt ytterligare populationer för att identifiera strukturella varianter med hjälp av långläst sekvensering från Oxford Nanopore och PacBio-teknologier. Forskningsuppgifterna inkluderar:
• Konstruktion av pangenomgrafer för att underlätta inpassning av både lång- och kortläst sekvenseringsdata.
• Identifiering av strukturella varianter och bedömning av deras påverkan på den genetiska belastningen.
• Undersökning av adaptiva strukturella varianter som kan spela en roll i evolutionära processer.
I takt med att projektet fortskrider finns möjlighet att inkludera ytterligare arter, såsom lodjur och varg.
Postdoktorn kommer att handledas av Dr. Tom van der Valk och vara baserad vid Centrum för paleogenomik i Stockholm, ett samarbetsinstitut mellan Naturhistoriska riksmuseet och Stockholms universitet.
KVALIFIKATIONER
För att lyckas i tjänsten behöver du uppfylla medan krav:
• Doktorsexamen i biologi eller ett närliggande ämne.
• Dokumenterad expertis inom ett relevant forskningsområde
• Utmärkt skriftlig och muntlig engelska
• Kunskap om teori inom populations- och bevarandegenomik samt praktisk erfarenhet av genomiska analyser
• Erfarenhet av analys av helgenomsekvenseringsdata (Oxford Nanopore, PacBio och/eller Illumina)
Utöver de grundläggande kvalifikationerna är erfarenhet inom följande områden meriterande
• Erfarenhet av att identifiera strukturella varianter från genomsekvenseringsdata
• Erfarenhet av bioinformatik, inklusive bash-kommandoradsskriptning samt programmering i Python och/eller R
• Erfarenhet av att arbeta med högpresterande datorkluster (HPC).
• Stort intresse för och erfarenhet av forskning inom bevarandegenomik
Du har stark analytisk förmåga och problemlösningsförmåga liksom förmåga att arbeta både självständigt och i samarbete med andra. Du har även en proaktiv och strukturerad inställning till forskning.
ÖVRIGT
Ansökan ska innehålla följande dokument:
• Ett personligt brev (max 1 sida) som inkluderar:
- En beskrivning av ditt forskningsintresse.
- En kort sammanfattning av din vetenskapliga bakgrund och forskningsintressen.
- En personlig reflektion kring hur dina kvalifikationer passar för denna tjänst.
• En meritförteckning (CV) som sammanfattar din utbildning, forskningserfarenhet och relevanta tjänster.
• En publikationslista samt akademiska arbeten som du vill att bedömningskommittén ska beakta.
• En kopia av din doktorsexamen.
• Kontaktuppgifter till två referenser, inklusive deras relation till dig, e-postadress och telefonnummer.
Vårt mål är att genom forskning och publik verksamhet visa vägen till ökad kunskap och handlingskraft, för att vi tillsammans ska kunna bidra till en hållbar och ljus framtid. Vår långsiktiga strävan är att Naturhistoriska riksmuseets anställda ska spegla den mångfald som finns i Sverige. Vi välkomnar alla sökanden oavsett kön, bakgrund, ursprung och funktionsvariation.
Inför rekryteringsarbetet har vi tagit ställning till rekryteringskanaler och marknadsföring. Vi undanbeder oss därför kontakt med mediesäljare, rekryteringssajter och liknande.